Указом определены полномочия ФМБА России, порядок организации деятельности агентства, а также предельная численность работников центрального аппарата ФМБА России и его территориальных органов.

Руководство деятельностью ФМБА России осуществляет Президент. Правительство в соответствии с указами, распоряжениями и поручениями Президента координирует деятельность агентства.

Предусмотрено, что ФМБА России вносит Президенту и в Правительство проекты федеральных законов, нормативных правовых актов и другие документы, по которым требуется решение Президента или Правительства, по вопросам деятельности агентства.

Настоящий указ вступает в силу со дня его подписания.