По НК РФ вычет по НДС можно заявить в течение 3 лет после принятия на учет купленных товаров (работ, услуг), имущественных прав.

Если налог уплатили при покупке ОС, оборудования к установке или НМА (указанных в п. п. 2 и 4 ст. 171 НК РФ), вычет в полном объеме можно применить только после того, как их приняли на учет.

НК РФ не предусматривает права на вычет НДС по одному счету-фактуре частями в разных налоговых периодах в течение 3 лет после принятия на учет ОС, оборудования к установке или НМА.

Сходные разъяснения ведомство уже давало.

Источник: КонсультантПлюс