Если в течение гарантийного срока налогоплательщик устраняет недостатки, которые выявили в ранее выполненных работах, НДС нужно платить в общем порядке. Не имеет значения, взимают ли дополнительную плату за эти операции.

Финансисты обосновали данную позицию тем, что такие операции не названы в перечнях операций, которые не являются объектом обложения НДС или освобождены от налогообложения.

Источник: КонсультантПлюс