Если покупатель принял товар на учет, но потом возвращает его, продавец должен выставить [1] корректировочный счет-фактуру. Такие правила действуют с 1 апреля этого года. Они применяются, даже если товар был принят на учет до этой даты.
Обычные же счета-фактуры выставляются [2], если возврат оформлен как обратная реализация. В этом случае необходим новый договор купли-продажи, в котором продавец и покупатель, по сути, меняются местами.
Минфин ранее уже направлял такие же разъяснения [3].
Links:
[1] consultantplus://offline/ref=main?base=QUEST;n=187376;dst=100006
[2] consultantplus://offline/ref=main?base=QUEST;n=187017;dst=100007
[3] http://ondb.consultant.ru/news/9946/
[4] consultantplus://offline/ref=main?base=QUEST;n=187017;dst=100006
[5] http://respectrb.ru/support
[6] http://respectrb.ru/node/9220