Зарегистрировать обособку можно через личный кабинет на сайте ФНС

Налоговики расширили функционал личного кабинета юрлица [1]. Теперь через него можно направлять документы для постановки на учет/снятия с учета обособленных подразделений.

В частности, в ЛК можно заполнить и направить сообщения:

- о создании обособленных подразделений;

- об изменении в сведениях об ОП:

- о прекращении деятельности через обособку.

Ответ на такое сообщение также придет в личный кабинет. Это будет соответствующее уведомление (о постановке на учет или снятии с учета по месту нахождения ОП) в формате PDF-документа с электронной подписью налогового органа.

Источник: "Главная книга" [2]

Документ: Информация ФНС [3]